خبرگزاری فارس که در شمار خبرگزاری های حامی دولت است به دلیل انتشار یک خبر در مورد احتمال برکناری یا استعفای طهماسب مظاهری رئیس کل بانک مرکزی به مدت سه روز از سوی وزارت ارشاد اسلامی توقیف شد.
حامد طالبی نویسنده وبلاگ «خبرنگار مسلمان» و خبرنگار گروه سیاسی فارس در واکنش به این خبر تجلیل احمدی نژاد از خبرگزاری فارس یادآوری می کند ، و می نویسد «محمود احمدينژاد پيش از ظهر امروز دوشنبه (18 تير 86) در جمع خبرنگاران فعال در سفرهاي استاني در پاسخ به سؤال خبرنگار خبرگزاري فارس در خصوص ارزيابي وي از نحوه عملكرد اين رسانه گفت: فارس از جمله خبرگزاريهاي خوب است. البته همه خبرگزاريهاي داخلي خوب هستند ولي خبرگزاري فارس چيز ديگري است.»
او همچنین به نقل از احمدی نژاد از ارتباط وی با این خبرگزاری خبرداده،و نوشته « از ابتداي تشكيل خبرگزاري فارس در جريان اين موضوع بودم.»
در بخش نظرات یکی از این خوانندگان این وبلاگ با نام «پابرهنه»خطاب به خبرنگار فارس نوشته «من با ایجاد محدودیت های این چنین برای رسانه های نوپای کشورمان اساسا مخالفم و البته مخالفت من هیچ اهمیتی نداره. ولی نکته اینجاست که هر کس تو این مملکت باد بکاره طوفان برداشت می کنه. کاش دوستان فارس اون زمون که دولتی ها خفت بقیه رسانه ها رو چسبیده بودن و مثلا ایلنا رو تعطیل کردن صداشون در می اومد. تا امروز خودشون این طوری مورد عنایت قرار نگیرن.»
امین صبحی خبرنگار دیگر این خبرگزاری در مورد پشت پرده توقیف فارس می نویسد«انتشار خبر زودهنگام، شتابزده و پيشقراولانه توقيف خبرگزاري فارس و ابلاغ چنين تصميمي از سوي خبرگزاري رسمي دولت، آن هم در ساعات نيمهشب در نوع خود جالب است. به نوعي ميتوان گفت بيشتر از همه ايرنا از توقيف فارس خوشحال و ذوق زده شده بود؛ كه دليل آن هم برهمگان روشن است.»
نویسنده وبلاگ دلم گرفت ای هم نفس در ادامه با اشاره به انتشار خبری که موجب توقیف سه روزه شده در ساعت 20 و 41 دقیقه شامگاه یک شنبه 12 خرداد،و انتشار خبر توقیف با فاصله 3 ساعته می نویسد« سئوال اينجاست كه هيئت نظارت بر خبرگزاريهاي غيردولتي در چه ساعتي از شب تشكيل شده و به چه سرعت اين جلسه منجر به تصميمگيري شده كه نامه توقيف به ساعت 24 روز دوازدهم اشاره دارد؟»
امین صبحی همچنین نوشته «اخبار موثق حاكي از آن است كه اصلاً چنين جلسهاي تشكيل نشده است و اكثر اعضاي آن با توقيف فارس به شدت مخالف بودهاند البته به جز جناب وزير و معاونان وی كه آن بندگان خدا نيز مجبور بودند.»
وبلاگ گوراب هم کلی از لینکهای مربوط به توقیف خبرگزاری فارس را جمع آوری کرده ،و البته واکنش احمدی نژاد به توقیف 3 روزه فارس را هم تیتر کرده؛«احمدی نژاد:فارس چرا توقیف شد؟!»
وبلاگ آسمونی که نویسنده آن یکی دیگر از خبرنگاران فارس است توقیف این خبرگزاری را بخشی از رقابت دو رسانه حامی دولت یعنی خبرگزاری ایرنا و خبرگزاری فارس دانسته و نوشته که فارس 4 یا 5 برابر خبرگزاری ایرنا بازدید کننده دارد.
اما نویسنده وبلاگ حرفه خبرنگار می نویسد«عاقبت خياط هم در كوزه افتاد و خبرگزاري دولتياي كه هميشه همه چيزش « پيش از آنكه فكر كني اتفاق ميافتاد » و منابع آگاهش خبر از توقيف مطبوعات ميدادند و بعد هم تكذيب ميشد و بعد از چند روز هم بالاخره فارس حرفش را به كرسي مينشاند، توقيف شد!»
فهیمه خضر حیدری که از روزنامه نگاران روزنامه های منتقد دولت است،در ادامه می نویسد«دولتمردان ما واقعا در رسالت خودشان آدمهاي جدياي هستند و اين همه پشتكار حقيقتا جاي تحسين دارد.آقايان حتي به بزرگترين متحد خودشان هم رحم نميكنند؛ حالا ديگر ما كجاي كار هستيم ؟»